生物肥具有以下特点:

一.来肥迅速、肥效持久 生物肥选用的氮、磷源均为I类、II类优等品，含量高、水溶性好。氮、磷配比更科学，既能自身发挥肥水功能，又能促进底泥中的氮、磷等元素向水体中释放。

生物肥添加的有机肥物一改传统的直接添加畜禽粪便等的做法，改用天然有机肥源，经特种微生物发酵制成发酵有机物，营养高、无病菌感染，分解时耗氧少。晴天上午使用，第二天即可感觉水色变化，透明度降低，正常情况下肥效可持续七天左右。培肥的水色为黄绿至黄褐色，以硅藻、裸藻、隐藻、金藻、轮虫等饵料价值高的浮游生物为主，与传统化肥培肥的墨绿色、蓝绿色以团状绿藻、蓝藻为主的水色有明显区别。

二.调节水质、改善底质 生物肥所含的微量元素、生物小肽、氨基酸除供给水生生物直接利用外，还可与水体底质中某些有害物质结合，解除其毒性，减少对养殖鱼、虾、蟹、蚌、贝等的毒害。同时在肥料中还添加了特殊物质溶解后剩下的细泥状物，具有较强的吸附、络合、沉降作用，可降低水体中的悬浮物及分解底质中的有害物质。

因此，使用时应将不溶的泥状物一并泼入水中，以免影响肥效。生物肥能促进水生植物进行光合作用，使水中溶解氧丰富，这对调节水质、改善底质也有很好的作用。

三.有效避免泛塘，促进鱼、虾、蟹、蚌、贝生长 生物肥中的生物小肽、生物酶、生物素等本身就是鱼类很好的促生长物质，可以直接被鱼虾蟹利用，另外水体中的初级生产者主要是藻类，养殖水体中溶解氧的主要来源也是靠水生植物的光合作用。

光合作用也称希尔反应的强弱主要取决于水体中水生植物的数量及光合作用的效率。生物肥中所含微量元素经过特殊处理，提高了其利用率的，其中的Cl、Mn、Co等能够提高光合作用效率。生物渔肥的微生物制剂不仅具有调水、改水性能，能净化水质，改善环境，避免池塘环境的恶化；同时，微生物制剂在水体中经过生长繁殖，本身就是鱼虾蟹很好的饵料资源，从而可以促进水体生产力与环境的科学和谐统一。

有机物的作用并不单纯是增加氮、碳等营养元素，有机物含有的特殊活性基团酚式羟基和酚式醌基对过氧化氢酶和多酚氧化酶活性也有促进作用，生物素也可增强藻类的新陈代谢，提高光合作用效率，合成较多的有机物和产生氧气。

四.提高免疫能力，预防疾病 生物肥所含的部分有机物如氨基酸复合酶有很好的抑制有害细菌的作用；其所含的微量元素如铁、锌、锰、钴、镁等能改善水生动物的生理机能，提高其免疫力，增强抗病力。同时，水体环境的改善、水中溶解氧的增加，也可以减少病害发生。

而且，生物肥用来改善水质的用量仅为常规用量的50％。 大量用户的使用实践证明:生物肥其养殖成本较传统的碳铵、磷肥略低或相当，但养殖的综合效益要高得多。