木霉能合成一些裂解酶，包括甘露糖酶、脂肪酶、磷酸酶等（Elad et al.，1983；Labudova et al.，1988）。

β-D-1，4-甘露聚糖酶是一类能够水解含有β-D-1，4-糖苷键的甘露寡糖、甘露多糖的内切水解酶。它属于半纤维素酶类，在造纸工业、食品工业和农业中有广泛的应用。里氏木霉Rut C-30所产生的甘露聚糖酶蛋白有5种，其中活性最高的两种酶已经获得纯化（Arisan-Atac et al.，1993；Stalbrand et al.，1993）。后来又发现，这两种甘露聚糖酶同属于基因man1的产物，该酶具有纤维素结合域，属于糖苷水解酶第五家族（Stalbrand et al.，1995）。里氏木霉的甘露聚糖酶基因在酿酒酵母中得到表达，但酶活力非常低，例如酿酒酵母表达里氏木霉man1，活力仅为1.3×10-2IU/mL（Aparicio et al.，2002）。韦跃华等（2005）利用毕赤酵母成功表达木霉甘露聚糖酶基因man1，获得了较高分泌表达的甘露聚糖酶的毕赤酵母基因工程菌株Gpmf25，发酵120h，重组甘露聚糖酶活力可达12.5IU/mL，比酿酒酵母表达的里氏木霉甘露聚糖酶的活力高出近 1000倍。Agrawal等（2011）将里氏木霉β-甘露聚糖酶的基因转入烟草中，促进了木质素生物质的水解。

脂肪酶（Lipase）是分解脂肪的酶，是最早研究的酶类之一。它可将甘油三酯分解成脂肪酸和甘油或进行其逆反应（张树政，1984）。微生物脂肪酶是工业用脂肪酶的主要来源。Götz等（1985）完成了猪葡萄球菌（Staphylococcus hyicus）和金黄色葡萄球菌（Staphylococcus aureus）中脂肪酶基因的克隆和序列测定，此后不同来源的脂肪酶的基因序列和蛋白质一级结构也被逐步阐明。随着基因工程和蛋白质工程的发展，脂肪酶的基因表达调控、蛋白质分子的改造也有了新的进展。1990年真菌脂肪酶Rhizomucor miehei li-pase（RML）和人胰脂肪酶两种不同脂肪酶的X-射线衍射晶体结构的报道，让脂肪酶研究进入结构和功能研究的新阶段。细菌、酵母、霉菌均筛选到较高酶活的菌株（彭立凤，1999）。隋聪颖等（2008）筛选到4株产脂肪酶的木霉菌株，编号为：153-1，13-2，30425，西1-1，根据菌株的菌落形态、显微镜观察和ITSrDNA 序列测定，鉴定该4菌株分别为哈茨木霉（T.harzianum）、长枝木霉（T.longibrachiatum）、哈茨木霉（T.harzianum）、长枝木霉（T.longibrachiatum），其酶活分别为4.79U/mL，2.41U/mL，5.32U/mL，3.30U/mL。Kashmiri等（2006）筛选了一株产脂肪酶的绿色木霉，在培养48h后，其产生的胞外脂肪酶活力为7.3U/mL，胞内脂肪酶活力则达到了320U/g菌丝体。Ulker等（2011）在哈茨木霉IDM14D中分离并鉴定了脂肪酶的活性。该脂肪酶在pH为8.0～10.0的范围内能保持稳定，Ca2+和Mn2+能够增强它的活性，但是其他矿物离子对他的活性没有明显影响。

磷酸酶是一种能够将对应底物去磷酸化的酶，即通过水解磷酸单酯将底物分子上的磷酸基团除去，并生成磷酸根离子和自由的羟基。蛋白磷酸酶与蛋白激酶共同调控着细胞内蛋白质可逆磷酸化过程，参与调控多种细胞生物学事件，包括细胞分化、信号转导等（Stefan et al.，1999）。随着哈茨木霉菌丝体时期的cDNA文库的完成，功能基因的验证成为首要任务。经过测序获得3298条成功EST序列（Liu et al.，2007）。刘燕等（2008）从哈茨木霉cDNA文库中克隆到丝/苏氨酸蛋白磷酸酶的全长cDNA序列（PP2A），并成功构建到原核表达载体，在大肠杆菌BL21 中高效表达可溶性蛋白。Aseri等（2009）对曲霉属、青霉属、木霉属和假散囊菌属的四种产磷酸酶菌株进行了分析和比较，发现与其他菌株相比，哈茨木霉产的磷酸酶的活性和裂解能力最强。Leitao等（2010）从哈茨木霉中分离纯化一种酸性磷酸酶，分子量为57.8kDa，最适温度和最适 pH 分别为55℃和4.8。该酶的活性能够被无机磷酸盐部分抑制，能够被钨酸盐完全抑制。

由于内酯酶在食品工业上的重要性，人们也研究了木霉菌株的内酯酶。内酯酶是合成一个完整纤维素酶系统的组成部分，它可以水解内酯化合物的内酯键产生羟基酸。从商品化的里氏木霉制剂中纯化一个内酯酶。这个酶能够在有1，5-葡萄糖酸内脂和纤维二糖酸内酯存在时表现活性（Bruchmann et al.，1987）。